顯微課堂 | 從概覽中查找相關(guān)樣本細(xì)節(jié)

在從圖像到圖像的搜索中切換到快速查看整個(gè)樣本概覽,并即刻識(shí)別重要的樣本細(xì)節(jié)。利用這些知識(shí),使用載玻片、培養(yǎng)皿和多孔板的模板自動(dòng)設(shè)置高分辨率圖像采集。LAS X Navigator 軟件像是樣本細(xì)胞的GPS,總能為用戶指明通向高質(zhì)量數(shù)據(jù)的清晰路徑,這是生命科學(xué)平臺(tái) STELLARIS 和 THUNDER 成像儀上的一款導(dǎo)航工具。LAS X Navigator 支持將寬場、立體或共聚焦實(shí)驗(yàn)與舞臺(tái)應(yīng)用相結(jié)合。
用戶可以迅速獲得標(biāo)本的整體概覽,找到感興趣區(qū)域(ROI),然后使用 LAS X Navigator 軟件輕松獲取高分辨率圖像。原因包括:
快速定位樣品
在培養(yǎng)皿中找到標(biāo)記清晰的細(xì)胞或在大塊腦組織切片中找到特定的 ROI 既困難又耗時(shí)。因?yàn)樵S多生物樣本的大小超過了顯微鏡的最大視場,這讓用戶很難確定自己在樣本中的位置。
通過 LAS X Navigator 的螺旋掃描功能,可以快速創(chuàng)建樣本概覽,選擇用于進(jìn)一步研究的 ROI。用戶只需點(diǎn)擊一下,就能獲取以當(dāng)前視場為中心的馬賽克掃描。
視頻 1:快速螺旋掃描大樣本,以便在選擇 ROI 之前對樣本有一個(gè)總體了解。樣本由荷蘭烏特勒支胡布勒支研究所的 Carlos Sacristan Lopez 博士提供。
在不同尺寸比例間無縫工作
用戶在獲取整體樣本的同時(shí),也希望看到精細(xì)的樣本細(xì)節(jié)。這意味著必須在不同尺寸比例間無縫切換。
用戶可以通過 LAS X Navigator 軟件在不同的目標(biāo)之間迅速切換,并以適當(dāng)?shù)募?xì)節(jié)級別掃描樣本。
更換物鏡時(shí),所有相關(guān)的拼圖的大小和位置參數(shù)都會(huì)自動(dòng)重新計(jì)算。此外,查看器功能可以顯示多個(gè)記錄的疊加,包括使用不同物鏡獲得的記錄。這樣,用戶可以首先快速獲取概覽,然后使用高分辨率的 z 堆棧從多個(gè)任意形狀的ROI 查看細(xì)節(jié),從而無縫地在不同尺度上探索樣本。
視頻 2:更換物鏡后放大并掃描標(biāo)本細(xì)節(jié)。樣本由荷蘭烏得勒支胡布勒支研究所的 Carlos Sacristan Lopez 博士提供。
在大樣本和時(shí)間延遲記錄期間保持對焦
在進(jìn)行此類實(shí)驗(yàn)時(shí),生物樣本和探針載體通常不是平整的,這些幾何缺陷和樣本在時(shí)間延遲記錄期間的漂移都可能導(dǎo)致失焦問題。
LASX Navigator 軟件提供了多種解決這些問題的方法。它可以通過手動(dòng)或自動(dòng)定義任意數(shù)量的焦點(diǎn),以創(chuàng)建所謂的“焦點(diǎn)圖”,以便對適當(dāng)?shù)?z 位置進(jìn)行插值。此外,由于“自適應(yīng)焦點(diǎn)控制”(AFC)已集成到軟件中,因此提供了一種非侵入性、快速的方法,可以在較長時(shí)間內(nèi)保持樣品對焦。

圖 1:LAS X Navigator 可以定義任意數(shù)量的焦點(diǎn)來構(gòu)建焦點(diǎn)圖。
陳列編輯和統(tǒng)計(jì)抽樣
當(dāng)用戶希望同時(shí)探查多種操作并希望獲得具有統(tǒng)計(jì)意義的結(jié)果時(shí),自然會(huì)選擇使用多孔載體以提高吞吐量。手動(dòng)設(shè)置這類實(shí)驗(yàn)既繁瑣也限制了生產(chǎn)率,因?yàn)槊總€(gè)孔都必須手動(dòng)獲取多個(gè)成像位置。
使用 LAS X Navigator 軟件的化驗(yàn)編輯器(需單獨(dú)購買許可證),用戶可以使用包括載玻片、培養(yǎng)皿和多孔板在內(nèi)的多種常見探針載體。用戶只需選擇正確的載體,并選擇他們希望如何對每個(gè)孔進(jìn)行統(tǒng)計(jì)抽樣。這種方法可以快速設(shè)置,從而專注于獲取有意義的結(jié)果。

圖 2:化驗(yàn)編輯器中標(biāo)準(zhǔn)載體的兩個(gè)示例。
預(yù)定義的 Navigator 可以進(jìn)一步加快速度。在下面的示例中,使用配備量子臺(tái)的 DMi8 寬場系統(tǒng)加載并執(zhí)行了一個(gè) 8 室載玻片協(xié)議,每個(gè)孔中有 3 個(gè)位置。
視頻 3:高速多孔檢測
綜合圖像拼接和分析
獲取高質(zhì)量數(shù)據(jù)固然重要,但此時(shí)實(shí)驗(yàn)尚未完成。用戶仍然需要拼接單張掃描圖像并進(jìn)行圖像分析。為此,LASX Navigator 軟件為此類工作流程提供了便利: 圖像采集完成后,可選擇使用選定的拼接算法自動(dòng)合并單個(gè)拼圖。此外,三維分析模塊(許可證可單獨(dú)獲?。┑奶幚砉δ芤鸭傻杰浖?,以支持整個(gè)工作流程。例如,處理流水線可用于描述剛剛記錄的細(xì)胞核,即分割細(xì)胞核、計(jì)數(shù)細(xì)胞核、測量細(xì)胞核大小等。

圖 3:LAS X 導(dǎo)航儀拼接圖像上的 3D 分析模塊。
圖像融合,整合外部圖像信息
如果樣品的預(yù)掃描已經(jīng)用另一個(gè)系統(tǒng)(例如徠卡寬場顯微鏡)完成,而現(xiàn)在需要用 STELLARIS 共聚焦顯微鏡進(jìn)行高分辨率掃描,該怎么辦?用戶自然希望將這些成像數(shù)據(jù)結(jié)合起來。不同來源的圖像可以通過 LAS X Navigator 軟件進(jìn)行導(dǎo)入和對齊。
用戶只需選擇要導(dǎo)入軟件的圖像,然后使用工具箱快速對齊圖像。這樣,即使是智能手機(jī)攝像頭的快照也可以用作鳥瞰圖,用于定義 ROI 并自動(dòng)掃描。

圖 4:LAS X 導(dǎo)航儀可從其他來源導(dǎo)入圖像。在所示示例中,共焦圖像與相機(jī)快照對齊。
將基于熒光壽命的成像技術(shù)與 STELLARIS
(TauSense 和 FALCON)相結(jié)合
有時(shí),用戶需要分離光譜重疊的熒光團(tuán),減少對信號(hào)的無用貢獻(xiàn)或研究微環(huán)境變化。雖然基于強(qiáng)度的成像信息仍然是熒光顯微鏡使用最多的維度,但許多人已經(jīng)學(xué)會(huì)欣賞基于熒光壽命的成像。
LASX 導(dǎo)航儀允許用戶通過載物臺(tái)應(yīng)用程序獲取熒光壽命數(shù)據(jù)。
TauSense 工具可用于 LASX 導(dǎo)航儀,使用 TauContrast 記錄平均到達(dá)時(shí)間的差異,或使用 TauSeparation 區(qū)分某些光譜重疊的熒光團(tuán)。此外,F(xiàn)ALCON 與 LASX Navigator 兼容。

圖 5:蛔蟲橫切面上不同結(jié)構(gòu)的識(shí)別。將基于熒光壽命的信息和熒光強(qiáng)度與階段應(yīng)用相結(jié)合,可提供額外的對比度來區(qū)分不同的結(jié)構(gòu)。LAS X 導(dǎo)航儀可在整個(gè)標(biāo)本上無縫執(zhí)行這項(xiàng)任務(wù)。
相關(guān)產(chǎn)品

STELLARIS 共聚焦顯微鏡平臺(tái)

THUNDER Imager Cell Spinning Disk 系統(tǒng)
相關(guān)產(chǎn)品
免責(zé)聲明
- 凡本網(wǎng)注明“來源:化工儀器網(wǎng)”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡(luò)有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品,未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的,應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用,并注明“來源:化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責(zé)任。
- 本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源(非化工儀器網(wǎng))的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點(diǎn)和對其真實(shí)性負(fù)責(zé),不承擔(dān)此類作品侵權(quán)行為的直接責(zé)任及連帶責(zé)任。其他媒體、網(wǎng)站或個(gè)人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時(shí),必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源,并自負(fù)版權(quán)等法律責(zé)任。
- 如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請?jiān)谧髌钒l(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系,否則視為放棄相關(guān)權(quán)利。
手機(jī)版
化工儀器網(wǎng)手機(jī)版
化工儀器網(wǎng)小程序
官方微信
公眾號(hào):chem17
掃碼關(guān)注視頻號(hào)















采購中心