大樣本隊列驗證,高效而精準——PCR-LDR&多重PCR擴增子捕獲+二代測序服務(wù)
當通過高通量測序篩選出候選陽性突變后,往往需要在成百上千的大樣本隊列中進行驗證,以評估其頻率、與表型的關(guān)聯(lián)性或臨床診斷效能。如何選擇一種既經(jīng)濟又可靠、既靈敏又高通量的驗證方法?我們提供兩種主力技術(shù)方案:PCR聯(lián)合連接酶檢測反應(yīng)(PCR-LDR)適用于已知位點的高通量分型;多重PCR擴增子捕獲+二代測序則兼顧已知和未知位點、可并行檢測數(shù)百個擴增子。
為什么需要專門的隊列驗證技術(shù)?
在突變發(fā)現(xiàn)階段,NGS雖然合適,但成本依然較高,且針對少量位點進行大樣本全基因組/外顯子測序的投入產(chǎn)出比不佳。因此,對已明確的少數(shù)候選位點進行大規(guī)模人群或樣本隊列的基因分型/突變篩查,需要采用中通量、低成本、高準確性的靶向技術(shù)。理想的技術(shù)應(yīng)滿足:可擴展性、靈敏度和特異性、經(jīng)濟高效。
我們提供的兩種核心服務(wù)——PCR-LDR和多重PCR擴增子捕獲+二代測序——正是基于這些需求設(shè)計,已在大量臨床與科研隊列項目中得到驗證。
方案一:PCR-LDR
準確率高:連接酶的識別特異性,能準確區(qū)分SNP、點突變。
低成本:無需測序儀,僅需普通PCR儀和毛細管電泳儀,實驗成本較低。
檢測靈活:能根據(jù)不同的檢測需求進行調(diào)整,單次操作可處理幾個到上百個樣本。
方案二:多重PCR擴增子捕獲+二代測序
超高通量:平均測序深度超過1000X,能夠同時對成百上千的位點進行檢測。
檢測范圍廣:可對SNP位點以及周圍序列進行測序,更準確,更靈敏。
測序質(zhì)量高:測序質(zhì)量Q30>90%,檢出率超過95%。
結(jié)語
隊列驗證是連接“突變發(fā)現(xiàn)”與“功能/臨床意義”的橋梁,選擇合適的技術(shù)平臺決定項目效率、數(shù)據(jù)質(zhì)量和最終結(jié)論的可信度。無論您需要經(jīng)濟高效的已知位點大規(guī)模分型(PCR-LDR),還是靈活深度的靶向區(qū)域測序(多重PCR+二代測序),我們都將用專業(yè)的技術(shù)、嚴謹?shù)馁|(zhì)控和貼心的服務(wù),為您的隊列驗證項目保駕護航。讓我們攜手,將候選突變轉(zhuǎn)化為可發(fā)表的科學發(fā)現(xiàn)和可落地的臨床標志物。
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