空間組學(xué)爆火之后,IHC還有存在的意義嗎?

當(dāng)空間組學(xué)、單細(xì)胞測序和 AI 生物學(xué)成為科研熱點(diǎn),一個(gè)問題開始被越來越多科研人員討論:傳統(tǒng) IHC 真的會被淘汰嗎?
核心觀點(diǎn):
單細(xì)胞測序不會殺死 IHC,空間組學(xué)也不會取代病理學(xué)。真正的未來不是替代,而是融合。
一個(gè)正在席卷生物醫(yī)學(xué)界的問題
過去幾年,如果你關(guān)注 AACR、ASCO、ESMO、SITC 或任何大型生物醫(yī)學(xué)會議,會發(fā)現(xiàn)一個(gè)明顯趨勢:
十年前最火的是 NGS,
五年前最火的是單細(xì)胞測序,
而今天,幾乎所有投資、媒體和科研討論都聚焦在一個(gè)詞上:空間生物學(xué)(Spatial Biology)。
10x Genomics、NanoString、Vizgen、Akoya、BGI 等公司正在爭奪這場“下一代組學(xué)革命”的入場券。與此同時(shí),一個(gè)越來越尖銳的問題開始出現(xiàn): IHC 會不會被淘汰?
畢竟,如果我們已經(jīng)能夠一次檢測上萬個(gè)基因,為什么還要去染一個(gè) Ki-67?如果空間組學(xué)可以解析整個(gè)腫瘤微環(huán)境,為什么還要看一張 PD-L1 切片?如果單細(xì)胞測序能夠識別幾十種免疫細(xì)胞亞群,為什么還要統(tǒng)計(jì) CD8 陽性細(xì)胞?
聽起來很有道理。但科學(xué)的發(fā)展,從來不是舊技術(shù)被新技術(shù)簡單消滅。
一個(gè)殘酷的現(xiàn)實(shí)
空間組學(xué)很火,但真正決定患者能不能使用某些靶向治療或免疫治療的,很多時(shí)候仍然是 IHC。
今天,單細(xì)胞測序不斷發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞亞群,空間組學(xué)不斷發(fā)現(xiàn)新的腫瘤生態(tài)位,AI 不斷提出新的預(yù)測模型。但當(dāng)病理科需要給出一份診斷報(bào)告時(shí),醫(yī)生真正依賴的仍然是一些經(jīng)過長期驗(yàn)證的標(biāo)志物。
HER2:乳腺癌和胃癌等腫瘤中的重要靶向治療判斷依據(jù),用于評估患者是否適合 HER2 靶向治療。
ER:雌激素受體,是乳腺癌內(nèi)分泌治療決策的重要依據(jù)。
PR:孕激素受體,通常與 ER 一起用于判斷乳腺癌激素依賴性和預(yù)后。
Ki-67:細(xì)胞增殖指數(shù),用于評估腫瘤增殖活躍程度和預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)。
PD-L1:免疫檢查點(diǎn)相關(guān)標(biāo)志物,是部分腫瘤免疫治療療效預(yù)測的重要參考。
CD3:T 細(xì)胞總標(biāo)志物,用于評估腫瘤組織中的 T 細(xì)胞浸潤情況。
CD8:細(xì)胞毒性 T 細(xì)胞標(biāo)志物,用于判斷抗腫瘤免疫活性和腫瘤微環(huán)境狀態(tài)。
這些指標(biāo)背后,仍然離不開高質(zhì)量抗體和 IHC??臻g組學(xué)可以發(fā)現(xiàn)更多新的細(xì)胞狀態(tài)和分子信號,但要讓這些發(fā)現(xiàn)真正轉(zhuǎn)化為臨床證據(jù),IHC 和 IF 仍然是不可替代的驗(yàn)證工具。
組學(xué)技術(shù)的誤解
臨床和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中,
假設(shè)你擁有一個(gè)腫瘤樣本。IHC 告訴你:PD-L1 陽性。這是一個(gè)簡單、直接、可用于判斷的問題。而空間轉(zhuǎn)錄組可能告訴你:20000 個(gè)基因表達(dá)譜、30 種細(xì)胞亞群、50 個(gè)細(xì)胞通訊網(wǎng)絡(luò)和數(shù)百萬個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)。
發(fā)現(xiàn)越來越容易,決策卻越來越困難。
這正是組學(xué)技術(shù)面臨的最難挑戰(zhàn)。它極大地?cái)U(kuò)展了我們理解疾病的能力,但從“發(fā)現(xiàn)”到“臨床判斷”,仍然需要一個(gè)可靠、標(biāo)準(zhǔn)化、可重復(fù)的驗(yàn)證過程。
為什么 IHC 活了幾十年還沒有被淘汰?
IHC 之所以長期存在,不是因?yàn)樗雌饋怼皞鹘y(tǒng)”,而是因?yàn)樗鉀Q的是非?,F(xiàn)實(shí)的問題。
一,它足夠便宜
一次空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)可能需要高昂成本,而一次 IHC 檢測的成本相對低得多。對于大多數(shù)醫(yī)院、實(shí)驗(yàn)室和常規(guī)病理檢測場景來說,成本永遠(yuǎn)是決定技術(shù)能否普及的重要因素。
第二,它足夠快
臨床不需要幾個(gè)月后的答案,臨床需要盡快給出判斷。復(fù)雜空間組學(xué)往往需要樣本處理、測序、圖像采集、數(shù)據(jù)分析和算法解釋,而 IHC 的工作流更加成熟和直接。
第三,它足夠可信
過去幾十年,大量臨床研究建立了 IHC 相關(guān)指標(biāo)的評分系統(tǒng)和判斷標(biāo)準(zhǔn)。HER2 如何評分,PD-L1 如何判讀,Ki-67 如何分層,這些都不是簡單的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,而是長期臨床證據(jù)積累的結(jié)果。
空間組學(xué)并沒有被高估
說 IHC 不會被淘汰,并不意味著空間組學(xué)被高估。恰恰相反,空間組學(xué)正在解決 IHC 很難單獨(dú)解決的問題。
IHC 可以告訴你:這里有 CD8 T 細(xì)胞。空間組學(xué)則進(jìn)一步告訴你:這些 CD8 T 細(xì)胞位于腫瘤邊緣還是腫瘤內(nèi)部?是否靠近 Treg?是否處于活化狀態(tài)?是否參與某種免疫排斥結(jié)構(gòu)?
這類信息對于理解腫瘤微環(huán)境、免疫治療耐藥和新型 biomarker 發(fā)現(xiàn)非常關(guān)鍵。過去我們研究癌細(xì)胞本身,未來我們更需要理解癌細(xì)胞周圍的生態(tài)系統(tǒng)。
真正的未來:融合,而不是替代
空間組學(xué)和 IHC 并不是競爭關(guān)系。它們更像是同一條科研鏈路上的不同環(huán)節(jié)。
空間組學(xué)負(fù)責(zé)發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞狀態(tài)和空間模式;
IHC 和 IF 負(fù)責(zé)驗(yàn)證這些發(fā)現(xiàn)是否真實(shí)存在。
單細(xì)胞測序提出假說;
抗體實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證假說。
AI 生成模型;
病理學(xué)確認(rèn)模型是否具有現(xiàn)實(shí)意義。
過去幾年大量空間組學(xué)論文發(fā)表后,研究人員最終仍然需要回到實(shí)驗(yàn)室,重新進(jìn)行 IHC、IF 或 multiplex IF 驗(yàn)證。
被忽視的贏家
如果空間組學(xué)繼續(xù)爆發(fā),真正受益的不只是儀器公司,也包括抗體和驗(yàn)證試劑供應(yīng)商。
每一個(gè)新的空間發(fā)現(xiàn),最終都需要被驗(yàn)證。每一個(gè)新的細(xì)胞亞群,最終都需要確認(rèn)其蛋白表達(dá)。每一個(gè)新的 biomarker,最終都需要證明它在真實(shí)組織中穩(wěn)定、可重復(fù)、可解釋。
這正是 Biorbyt 可以發(fā)揮價(jià)值的地方。Biorbyt 為腫瘤微環(huán)境、免疫檢查點(diǎn)、細(xì)胞增殖、上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化和空間生物學(xué)驗(yàn)證研究提供抗體、重組蛋白、ELISA 試劑盒和相關(guān)科研工具。
相關(guān)研究標(biāo)志物包括:
PD-L1、PD-1、CD3、CD4、CD8、CD68、CD163、FOXP3、Ki-67、HER2、EGFR、α-SMA、FAP、Vimentin 等。
這些標(biāo)志物廣泛用于 IHC、IF、multiplex IF、腫瘤微環(huán)境分析和 biomarker 驗(yàn)證研究。




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