伯樂(lè)Trans-Blot Turbo蛋白轉(zhuǎn)印系統(tǒng)轉(zhuǎn)印不干凈
伯樂(lè) Trans-Blot Turbo 快速轉(zhuǎn)印系統(tǒng),轉(zhuǎn)印后高分子量蛋白(通常指 >100 kDa)殘留或效率低,是個(gè)典型問(wèn)題。這套系統(tǒng)雖然快速高效,但對(duì)蛋白的轉(zhuǎn)印確實(shí)不如傳統(tǒng)濕轉(zhuǎn)(過(guò)夜)理想,需要專門優(yōu)化。
下面幫你從程序設(shè)置、耗材匹配、緩沖液調(diào)整、樣品前處理四個(gè)角度分析原因,并給出可落地的解決方法。
一、程序設(shè)置不當(dāng)(常見(jiàn)原因)
Turbo 系統(tǒng)的內(nèi)置程序多是為中等分子量蛋白(30-150 kDa)優(yōu)化的,對(duì)蛋白的“遷移時(shí)間”或“電壓-電流曲線”可能不足。
1、錯(cuò)用程序:用了“Mixed MW”或“Low MW”程序,時(shí)間太短(3-5分鐘)。
2、解決方案:
(1)使用 “High MW” 程序(如果有)。部分型號(hào)軟件里有針對(duì) >150 kDa 的程序,通常電壓較低、時(shí)間延長(zhǎng)到 7-10 分鐘。
(2)自定義程序:更可靠的方法是手動(dòng)設(shè)置。
對(duì)于 100-200 kDa:設(shè)置 2.5 A 恒定電流(MAX電壓 25 V),轉(zhuǎn)印 7-10 分鐘。
對(duì)于 >200 kDa:設(shè)置 2.5 A,轉(zhuǎn)印 10-15 分鐘。甚至可以連續(xù)轉(zhuǎn)印兩次(中間換新濾紙)。
(3)注意:不要超過(guò)說(shuō)明書(shū)建議的長(zhǎng)轉(zhuǎn)印時(shí)間(通常15分鐘),否則發(fā)熱可能導(dǎo)致膜變形或背景升高。
2、轉(zhuǎn)印包/耗材不匹配或平衡不足
Turbo 系統(tǒng)必須使用專用的轉(zhuǎn)印包(Trans-Blot Turbo Transfer Packs)或嚴(yán)格匹配的自組裝耗材。不匹配會(huì)導(dǎo)致電場(chǎng)不均或離子強(qiáng)度異常。
(1)緩沖液離子強(qiáng)度低:蛋白需要較高的離子強(qiáng)度來(lái)維持帶電狀態(tài)和遷移驅(qū)動(dòng)力。
(2)如果使用自己配的緩沖液,推薦配方(與伯樂(lè)配方接近):
陽(yáng)極液:25 mM Tris,192 mM Glycine,pH 8.3(不含甲醇,不含SDS)。
陰極液:25 mM Tris,192 mM Glycine,0.1% SDS,pH 8.3(含SDS,對(duì)蛋白至關(guān)重要)。
說(shuō)明:SDS 能幫助蛋白從凝膠中釋放并保持溶解狀態(tài);甲醇會(huì)抑制蛋白遷移,因此陰極液絕對(duì)不加甲醇,陽(yáng)極液也最好不加。
(3)直接買預(yù)制的 Turbo 轉(zhuǎn)印包(貨號(hào) 1704274 或 1704275),它們的配方對(duì)高分子量蛋白經(jīng)過(guò)優(yōu)化。
(4)濾紙/凝膠平衡不充分:將凝膠和膜在對(duì)應(yīng)的緩沖液中平衡 5-10 分鐘,讓凝膠中的緩沖液組成與陰極液一致。對(duì)厚膠(如 1.5 mm)尤其重要。
3、膜的選擇和處理
(1)孔徑太?。篜VDF 膜的常用孔徑是 0.2 μm,這有利于結(jié)合小蛋白,但對(duì) >200 kDa 的蛋白可能會(huì)阻礙其穿透膜表面,導(dǎo)致蛋白沉積在膜表面甚至留在凝膠中。
改用 0.45 μm PVDF 膜(貨號(hào) 1620177 或兼容的 0.45 μm)。蛋白更容易進(jìn)入膜孔內(nèi)部。
NC 膜:0.45 μm NC 膜也可以,但機(jī)械強(qiáng)度較差,適合不需要多次剝離的轉(zhuǎn)印。
(2)甲醇活化不足:PVDF 膜必須用純甲醇浸泡至少 30 秒(1分鐘更好),然后立即用緩沖液(陽(yáng)極液)洗去甲醇。如果活化處理不干凈,膜疏水性強(qiáng),蛋白結(jié)合能力差。
4、凝膠和樣品方面
(1)凝膠濃度過(guò)高:蛋白遷移慢,如果使用 10% 或更高濃度的聚丙烯酰胺凝膠,蛋白會(huì)被截留在凝膠中。
(2)推薦使用 6-8% 的分離膠,甚至 4-12% 梯度膠。更低的交聯(lián)度有利于蛋白通過(guò)。
(3)樣品上樣量過(guò)大:蛋白容易在高濃度下聚集或沉淀在孔底。適當(dāng)減少上樣量(比如 20 μg 降至 10-15 μg),同時(shí)提高抗體靈敏度。
(4)轉(zhuǎn)印前未用 SDS 平衡凝膠:將凝膠在陰極液(含 0.1% SDS)中搖動(dòng)平衡 10 分鐘,使凝膠中的 SDS 濃度升高,維持蛋白的負(fù)電荷和溶解狀態(tài)。
二、實(shí)操快速排查表(針對(duì) >150 kDa 蛋白)
1、改用 6-8% 凝膠或 4-15% 梯度膠
關(guān)鍵點(diǎn):降低凝膠阻力
2、凝膠在 陰極液(含 0.1% SDS,無(wú)甲醇) 中平衡 10 分鐘
關(guān)鍵點(diǎn):保持蛋白溶解
3、使用 0.45 μm PVDF 膜,先用純甲醇活化 1 分鐘,再用陽(yáng)極液漂洗
關(guān)鍵點(diǎn):增大膜孔徑
4、按順序組裝:濾紙(陰極) - 凝膠 - 膜 - 濾紙(陽(yáng)極)
關(guān)鍵點(diǎn):注意:膜在陽(yáng)極側(cè)
5、選擇自定義程序:2.5 A 恒流,25 V 限制,轉(zhuǎn)印 12 分鐘
關(guān)鍵點(diǎn):足夠的時(shí)間
6、轉(zhuǎn)印結(jié)束后,用麗春紅S染色膜檢查蛋白條帶
關(guān)鍵點(diǎn):快速確認(rèn)是否轉(zhuǎn)過(guò)去
三、如果上述優(yōu)化后仍不理想
1、嘗試“兩步轉(zhuǎn)印”:先用標(biāo)準(zhǔn) Turbo 程序轉(zhuǎn)印 7 分鐘,然后更換新的濕濾紙(相同緩沖液),再轉(zhuǎn)印 7 分鐘(方向相同)。第二次轉(zhuǎn)印可以洗脫殘余在凝膠中的蛋白。
2、放棄快速轉(zhuǎn)印,改用傳統(tǒng)濕轉(zhuǎn):對(duì)于 >250 kDa 的蛋白(如 肌球蛋白、一些膜蛋白),Trans-Blot Turbo 很難達(dá)到濕轉(zhuǎn)過(guò)夜(20-30 V,12-16 小時(shí),在 4℃ 下)的效率。這種情況下,建議回到 Mini Trans-Blot 濕轉(zhuǎn)體系,并在緩沖液中加 0.1% SDS,不加甲醇。
3、如果需要,我可以幫你計(jì)算針對(duì)你目標(biāo)蛋白(例如分子量具體多少)的濕轉(zhuǎn)最佳電壓和時(shí)間。
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