PCR 假陰性(無(wú)擴(kuò)增條帶)如何快速排查
PCR 假陰性(無(wú)擴(kuò)增條帶)快速排查清單(實(shí)驗(yàn)室直接可用)
第一步:先看 3 個(gè)對(duì)照,定位大方向
陽(yáng)性對(duì)照:無(wú)條帶 → 試劑、程序、儀器、配體系問(wèn)題
陰性對(duì)照:無(wú)條帶 → 無(wú)污染,可排除污染干擾
樣本孔:wei獨(dú)樣本無(wú)條帶 → 模板本身問(wèn)題(降解 / 濃度低 / 有抑制物)
第二步:試劑與體系排查(對(duì)照無(wú)條帶優(yōu)先查)
Taq 酶是否過(guò)期、是否室溫放置失活
是否漏加:酶、Buffer、Mg2?、dNTP、引物
Mg2?濃度是否偏低
試劑是否反復(fù)凍融、反復(fù)開(kāi)蓋污染
體系配制是否在冰上操作
第三步:引物排查
引物是否過(guò)期、降解、稀釋后久放
退火溫度是否過(guò)高(最易不出條帶)
引物有無(wú)發(fā)夾、二聚體、與模板不匹配
更換新引物重試
第四步:模板核酸排查(樣本無(wú)條帶重點(diǎn)查)
核酸是否降解(反復(fù)凍融、放置過(guò)久)
模板濃度過(guò)低、上樣量太少
樣本含抑制物:酚、乙醇、高鹽、血紅蛋白、肝素等
處理方式:模板1:5~1:10 稀釋后重?cái)U(kuò)
重新提取新鮮核酸
第五步:PCR 擴(kuò)增程序 & 儀器
退火溫度偏高 → 做溫度梯度下調(diào)摸索
起始變性溫度 / 時(shí)間不足,雙鏈未解鏈
儀器孔位溫度漂移,換孔 / 換儀器驗(yàn)證
第六步:電泳及人為操作
瓊脂糖凝膠濃度配制錯(cuò)誤
電泳時(shí)間、電壓不合適
核酸染色不充分、上樣量過(guò)少
加樣順序錯(cuò)誤、交叉污染、配體系算錯(cuò)體積
第七步:標(biāo)準(zhǔn)解決操作流程
先跑陽(yáng)性對(duì)照,區(qū)分試劑問(wèn)題還是模板問(wèn)題
退火溫度做梯度 PCR
樣本模板稀釋后重新擴(kuò)增
換新酶、新引物、重新提核酸
核對(duì) PCR 程序參數(shù),必要時(shí)微調(diào)變性、退火時(shí)間
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