
標(biāo)準(zhǔn)的酵母單雜交實(shí)驗(yàn)通常分為五個(gè)階段:
①構(gòu)建誘餌酵母菌株:將Bait載體轉(zhuǎn)入酵母,獲得穩(wěn)定攜帶目標(biāo)DNA序列的菌株。
②構(gòu)建cDNA表達(dá)文庫(kù):將待篩選的轉(zhuǎn)錄因子編碼序列克隆到Prey載體上,構(gòu)建AD融合文庫(kù)。
③cDNA文庫(kù)轉(zhuǎn)化至誘餌酵母細(xì)胞:將Prey文庫(kù)轉(zhuǎn)入已含Bait的酵母中。
④陽(yáng)性克隆篩選:通過(guò)報(bào)告基因(如營(yíng)養(yǎng)缺陷型標(biāo)記、熒光、酶活)進(jìn)行初篩。
⑤互作克隆驗(yàn)證:將初篩到的陽(yáng)性克隆重新進(jìn)行一對(duì)一驗(yàn)證,排除假陽(yáng)性。
Bait序列設(shè)計(jì):確保目的DNA片段包含核心結(jié)合基序,長(zhǎng)度通常不小于3個(gè)串聯(lián)重復(fù)拷貝,以增強(qiáng)信號(hào)。
報(bào)告基因選擇:常用的有HIS3、LacZ、GFP等,可配合多個(gè)報(bào)告基因進(jìn)行交叉驗(yàn)證。
Prey表達(dá)校正:需確認(rèn)AD融合蛋白在酵母中正常表達(dá)且折疊正確,避免因蛋白不穩(wěn)定導(dǎo)致的假陰性。
可選用商業(yè)化的酵母單雜交試劑盒,或預(yù)先制備好“誘餌菌株"庫(kù)存,將實(shí)驗(yàn)壓縮至3~4周。同時(shí),文庫(kù)轉(zhuǎn)化效率直接決定篩選覆蓋面,務(wù)必使用高效轉(zhuǎn)化法(如LiAc/PEG法)并做平行轉(zhuǎn)化對(duì)照。
掌握以上流程,即可系統(tǒng)性地推進(jìn)DNA-蛋白互作研究,從文庫(kù)中“釣"出你感興趣的轉(zhuǎn)錄因子。
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