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當(dāng)前位置:武漢艾美捷科技有限公司>>技術(shù)文章>>Rho GTPases GEF 篩選試劑盒:生物活性測定方法解決方案
一、產(chǎn)品概述
本試劑盒專為體外鑒定和表征小 G 蛋白(Cdc42、Rac1 和 RhoA)的鳥嘌呤核苷酸交換因子(Guanine nucleotide Exchange Factor, GEF)而設(shè)計(jì),Rho GTPases GEF 篩選試劑盒由Cytoskeleton推出,艾美捷代理。試劑盒采用熒光檢測方法,基于純化蛋白進(jìn)行反應(yīng),不適用于細(xì)胞裂解液。該工具可支持 GEF 活性生化表征、新型 GEF 蛋白的篩選以及 GEF 抑制劑的高通量篩選。
二、核心應(yīng)用場景
鑒定 Cdc42、Rac1 或 RhoA 的 GEF 蛋白:使用純化蛋白進(jìn)行體外測定,快速判斷目標(biāo)蛋白是否對特定 Rho GTPase 具有交換活性。
GEF 活性的生化表征:定量分析 GEF 的催化效率、底物特異性及動(dòng)力學(xué)參數(shù)。
高通量篩選 GEF 抑制劑:采用 384 孔板格式,適用于大規(guī)?;衔镂膸旌Y選,尋找靶向特定 GEF-Rho 相互作用的小分子調(diào)節(jié)劑。
三、試劑盒內(nèi)容(每盒支持 20–130 次測定,視 GTPase 種類而定)
組分 | 說明
Exchange buffer | 交換緩沖液,提供反應(yīng)所需離子環(huán)境
Cdc42-His 蛋白 | 重組 His 標(biāo)簽 Cdc42 蛋白
RhoA-His 蛋白 | 重組 His 標(biāo)簽 RhoA 蛋白
Rac1-His 蛋白 | 重組 His 標(biāo)簽 Rac1 蛋白
hDbs-His 蛋白 | 重組 His 標(biāo)簽人 Dbs 蛋白(已知 GEF,用作陽性對照)
384 孔板 | 高通量篩選用微孔板
96 孔板 | 常規(guī)檢測用微孔板
四、所需設(shè)備與材料
溫控?zé)晒庾x數(shù)儀:激發(fā)波長 485 nm ± 20 nm,發(fā)射波長 535 nm ± 20 nm。
移液器、多道移液器或自動(dòng)液體處理工作站(推薦用于高通量篩選)。
純化待測 GEF 蛋白(用戶自備)或化合物文庫(用于抑制劑篩選)。
五、檢測原理
本試劑盒基于熒光標(biāo)記的鳥嘌呤核苷酸類似物在自由狀態(tài)與結(jié)合狀態(tài)下的光譜差異。當(dāng)熒光核苷酸類似物與 Rho GTPase 結(jié)合時(shí),熒光強(qiáng)度顯著增強(qiáng)。在待測 GEF 存在下,GTPase 加速交換結(jié)合的 GDP 為熒光核苷酸類似物,導(dǎo)致熒光信號(hào)隨時(shí)間升高。通過監(jiān)測熒光強(qiáng)度的變化速率,即可定量評估 GEF 活性。
檢測參數(shù):
激發(fā)波長:485 nm
發(fā)射波長:535 nm
檢測時(shí)長:約 2 小時(shí)
六、生物活性測定方法(標(biāo)準(zhǔn)流程)
以下為使用已知 GEF(如 hDbs)驗(yàn)證試劑盒性能的典型步驟。用戶可根據(jù)自身待測 GEF 進(jìn)行調(diào)整。
1. 試劑準(zhǔn)備
將 Exchange buffer 平衡至室溫。
解凍各 GTPase 蛋白(Cdc42、Rac1、RhoA)和陽性對照 hDbs 蛋白,置于冰上。
準(zhǔn)備熒光核苷酸類似物(試劑盒未提供,需另行購買或按實(shí)驗(yàn)室常規(guī)配方配制)。
2. 反應(yīng)體系配制(96 孔板格式)
每孔終體積通常為 50–100 μl,包含:
1× Exchange buffer
50–100 nM 目標(biāo) GTPase
0.5–2 μM 熒光核苷酸類似物
待測 GEF 蛋白(濃度范圍:1–500 nM,根據(jù)預(yù)實(shí)驗(yàn)確定)
陽性對照孔:加入 hDbs 蛋白(終濃度約 10–50 nM)
陰性對照孔:不加 GEF 或用 Exchange buffer 替代
3. 熒光監(jiān)測
將反應(yīng)板置于溫控?zé)晒庾x數(shù)儀中,設(shè)定激發(fā) 485 nm,發(fā)射 535 nm。
溫度控制:22°C 或 30°C(根據(jù) GEF 活性最適溫度調(diào)整)。
每 30–60 秒讀取一次熒光值,持續(xù) 1–2 小時(shí)。
4. 數(shù)據(jù)分析
計(jì)算每個(gè)時(shí)間點(diǎn)的熒光強(qiáng)度變化(ΔF = F? – F?)。
對時(shí)間作圖,曲線斜率為初始交換速率。
將待測 GEF 孔的速率與陰性對照孔比較,計(jì)算相對活性。
陽性對照(hDbs)應(yīng)顯示出顯著高于背景的熒光增強(qiáng)。
七、關(guān)鍵特性總結(jié)
特性 | 描述
檢測方法 | 熒光法(Ex 485 nm / Em 535 nm)
檢測靶點(diǎn) | Cdc42、Rac1、RhoA
陽性對照 | hDbs(人 Dbs 蛋白,His 標(biāo)簽)
適用樣本 | 純化蛋白(不適用于細(xì)胞裂解液)
檢測通量 | 96 孔或 384 孔板格式
檢測時(shí)長 | 約 2 小時(shí)
主要用途 | GEF 鑒定、生化表征、抑制劑高通量篩選
八、注意事項(xiàng)與優(yōu)化建議
1. 不適用細(xì)胞裂解液:裂解液中含有核苷酸、鹽分及其他干擾物質(zhì),會(huì)嚴(yán)重影響熒光核苷酸類似物的結(jié)合特異性,導(dǎo)致假陽性或假陰性結(jié)果。必須使用純化的待測 GEF 蛋白。
2. GTPase 預(yù)加載:部分實(shí)驗(yàn)方案建議先將 GTPase 與未標(biāo)記 GDP 孵育,以確保其處于 GDP 結(jié)合狀態(tài),提高交換效率。本試劑盒的 Exchange buffer 已優(yōu)化,但用戶可根據(jù)經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行調(diào)整。
3. 蛋白濃度優(yōu)化:不同 GEF 的催化效率差異可達(dá) 1000 倍以上,建議對待測 GEF 進(jìn)行濃度梯度預(yù)實(shí)驗(yàn)(例如 1、10、100、500 nM)。
4. 陽性對照驗(yàn)證:s次使用試劑盒時(shí),務(wù)必運(yùn)行 hDbs 陽性對照孔,以確認(rèn)試劑盒組分活性。hDbs 對 RhoA 和 Cdc42 均有交換活性,對 Rac1 活性較弱,可作為底物特異性參照。
5. 高通量篩選格式:使用 384 孔板時(shí),反應(yīng)體積可縮小至 20–30 μl。推薦使用自動(dòng)液體工作站以確保加樣精度。篩選抑制劑時(shí),先加入化合物與 GEF 預(yù)孵育 10–15 分鐘,再加入 GTPase 和熒光核苷酸類似物啟動(dòng)反應(yīng)。
6. 數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化:將待測孔熒光速率與陽性對照孔(設(shè)為 100%)和陰性對照孔(設(shè)為 0%)進(jìn)行比較,計(jì)算相對活性百分比。
警告:本產(chǎn)品僅限研究使用,不適用于人類或獸醫(yī)治療。
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